Créée en 1993 à l’instigation d’une poignée d’éleveurs en France, l’AFT signe la même année une Convention avec les Haras Nationaux reconnaissant le stud book du Trakehner. Cette convention apporte ainsi aux éleveurs la légitimité de leur élevage en France.

L’association allemande (Trakehner Verband) de son côté a reconnu l’association française également en 1993, lors du grand rassemblement annuel des étalons à Neümunster. L’agrément allemand donné à l’association française lui permet, sous réserve du respect des normes de qualité de la race, d’utiliser la marque Trakehner (le double bois d’élan) pour le marquage des chevaux. A cette marque l’association française a ajouté un F doublé, créant ainsi une marque déposée unique, reconnue par tous.